Это ведь так просто.
1. На изготовление машины времени надо много времени и ресурсов. Машина времени не есть роскошь а лишь средство передвижения во времени. А потому наверно хорошо охранялась!
2. На ведение войны нужны ресурсы которых разумеется не было у сопротивления. Любая фабрика былабы сразу уничтожена системой Skynet, или захвачена. Во всех фильмах сопративленцы прячутся и ничего не производят, только бегают и тратят патроны в пустую.
3. Уничтожив людей Skynet стало скучно и оно решило развлечся, посылать киборгов убить Джона, а других защитить, для защиты Skynet скопировало своё сознание в лучшего киборга и в дорогу.

Кэмерон Филлипс создан Скайнетом с человеческого прототипа (Эллисон Янг). Цель - убить Джона. Эллисон Янг находилась в ближайшем окружении Джона (это видно по финалу 22-й серии). Как Джон распознал, что Эллисон подменили терминатором, почему перепрограммировал ее вместо того чтобы просто уничтожить?

Может, Эллисон к тому времени была мертва, но он ее любил и решил создать клона своей любви в виде перепрограммированного робота, но потом разочаровался и отправил ее в прошлое?

А война с людьми отнимает много сил и энергии